2009年，所属陕西、厦门等证监局超比例缴存住房公积金85.38万元；安徽、江西等证监局在“职工福利基金”科目中列支职工津贴补贴58.8万元；陕西、安徽证监局在“稽查办案费”科目中列支公用经费15.82万元；安徽证监局通过扩大提租补贴发放范围等方式为该局职工发放津贴补贴20.97万元。

保监会提高标准支出213.71万元

2007年至2009年，所属四川保监局超标准发放交通补贴等共计206.34万元，其中2009年发放34.46万元；2009年，所属广东保监局超标准发放职工津贴补贴7.37万元。

社保基金会虚假发票报账371.69万元

2007年至2009年，社保基金会作为报账凭证的发票中，有虚假发票，报账金额合计371.69万元；有开票单位与实际收款单位不一致或与实际经济内容不符的发票，报账金额合计40.72万元。

国家档案局扩大范围支出2017.75万元

2009年，档案局在基本支出中列支1236.98万元、在项目支出中列支621.45万元，分别用于无预算的礼堂局部装修、道路改造以及车辆修理、购置礼品等支出；所属档案科学技术研究所和中国第一历史档案馆在5个项目经费中，分别列支130.62万元、28.7万元，用于购置设备、旅行车及旅游支出。

国家信访局预算执行率低,影响资金使用效益

信访局2009年部门预算中，“信访立法工作经费”等2个项目的预算未按实际需求编列，其中4项明细支出预算共计108万元，当年均未执行；“信访法制化建设”等2个项目预算当年执行率分别仅为11.23%和22.95%，年底结转资金57.45万元。

国家粮食局公务用车超编17辆

至2009年底，粮食局实有公务用车40辆，超编17辆。其中：局机关用车超编12辆，离退休干部用车超编5辆。

外国专家局审计问题金额42.50万元

外专局本级及所属单位2009年度预算支出共计46704.73万元，占部门预算支出总额的99.31%。审计查出当年预算执行中不符合财经制度规定的问题金额42.50万元，占审计预算资金额的0.09%。

外交部1.4亿资金未纳入统筹安排

2009年，外交部有14个项目超预算支出14 115.71万元，资金全部来源于以前年度财政拨款项目结余，这些结余资金及支出安排均未编入当年部门预算。
国家发改委660万元津贴补贴未计入本级支出

2009年11月至12月，发展改革委用11家所属单位上缴款660万元发放委机关在职人员津贴补贴，在会计记账时直接列作机关服务中心事业支出，未计入委本级支出。